Гарри Поттер снова едет в Хогвартс, теперь уже на второй год обучения. Незадолго до отъезда странный домашний эльф по имени Добби появляется у него в комнате. Эльф умоляет не возвращаться в школу, говорит о какой-то скрытой угрозе. Но Гарри не слушает эти предостережения.
В стенах замка вскоре начинают происходить странные вещи. Гарри с Роном и Гермионой постепенно понимают: всё связано с легендарной Тайной Комнатой. Говорят, её открыл наследник Слизерина. Учеников один за другим находят окаменевшими. Гермиона тоже попадает под действие древнего заклятья.
Трое друзей начинают собственное расследование. Им приходится искать подсказки, расспрашивать призраков, даже превращаться в других людей с помощью Оборотного зелья. Постепенно они узнают правду о самом первом нападении много лет назад. Всё указывает на то, что монстр из легенды действительно существует и скрывается в трубах замка.
В конце концов Гарри находит вход в Тайную Комнату. Там его ждёт не только гигантский василиск, но и память о Томе Реддле, запечатлённая в дневнике. Выясняется, что именно этот дневник, попавший к Джинни Уизли, и управлял событиями. С помощью меча Годрика Гриффиндора и верности феникса Фоукса Гарри удаётся уничтожить и дневник, и чудовище. Джинни освобождается от влияния тёмной магии, а школа возвращается к привычной жизни — пока что.